Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms