Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A10Q6U841 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A10Q6U841 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms