Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCD3Q6STE5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCD3Q6STE5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms