Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms