Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAVIN1Q6NZI2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms