Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms