Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC1Q5VXU3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms