Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GKAP1Q5VSY0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms