Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLC9C2Q5TAH2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms