Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP70Q5T0N1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP70Q5T0N1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms