Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47A1Q5JQC4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47A1Q5JQC4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47A1Q5JQC4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47A1Q5JQC4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47A1Q5JQC4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms