Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms