Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms