Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms