Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms