Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms