Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms