Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1FQ16864 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1FQ16864 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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