Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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