Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FXNQ16595 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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FXNQ16595 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FXNQ16595 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FXNQ16595 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FXNQ16595 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FXNQ16595 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FXNQ16595 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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FXNQ16595 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FXNQ16595 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FXNQ16595 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FXNQ16595 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FXNQ16595 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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