Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC37Q16543 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms