Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms