Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC1A5Q15758 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms