Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPAQ15257 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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PTPAQ15257 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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