Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1I3Q14994 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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