Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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