Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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