Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1CQ14123 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1CQ14123 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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