Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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