Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK13Q14004 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK13Q14004 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
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