Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRF1Q13972 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms