Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PPP1R1AQ13522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PPP1R1AQ13522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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