Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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