Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATMQ13315 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATMQ13315 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATMQ13315 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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