Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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