Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RESTQ13127 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RESTQ13127 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RESTQ13127 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RESTQ13127 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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