Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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