Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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IFT88Q13099 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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IFT88Q13099 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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IFT88Q13099 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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