Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFCP2Q12800 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TFCP2Q12800 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms