Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms