Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms