Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms