Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms