Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms