Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms