Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNB3Q05901 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms