Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP27A1Q02318 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms