Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms