Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK3Q00526 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms