Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms